Đáng chú ý, hiện tượng buôn lậu các loại ma túy, sản phẩm động vật hoang dã qua cảng hàng không và đường bộ; lợi dụng hình thức quá cảnh, trung chuyển để buôn lậu, trốn thuế... ngày càng phức tạp. Cơ quan hải quan khởi tố 34 vụ, chuyển cơ quan khác khởi tố 49 vụ án hình sự. Số thu từ công tác chống buôn lậu, hàng giả đóng góp lớn vào tổng thu ngân sách chung của ngành Hải quan. Theo thống kê, 9 tháng đầu năm 2017, toàn ngành thu được 214.000 tỷ đồng, đạt 75% dự toán.