Ông Phạm Thế Dũng trong trong hai nhiệm kỳ 2006-2010 và 2010-2016 với hàng loạt sai phạm khó khắc phục Theo đó, cơ quan chức năng đã hủy quyết định bổ nhiệm chức vụ Chánh thanh tra Sở Nội vụ Gia Lai đối với ông Phạm Trần Anh (con trai ông Dũng), hiện giữ chức vụ phụ trách phó Chánh thanh tra Sở Nội vụ Gia Lai. Em gái cùng cha khác mẹ của ông Dũng là bà Trần Thị Lý (Phó ban Dân tộc tỉnh Gia Lai) đã thôi việc. Riêng trường hợp ông Phạm Đức Mạnh (chồng bà Lý - Phó chi cục trưởng Chi cục Quản lý thị trường Gia Lai) đã bị cho thôi chức vụ, thành nhân viên bình thường.
Theo kết luận của Ủy ban Kiểm tra Trung ương, trong hai nhiệm kỳ (2006-2010 và 2010-2016) làm Chủ tịch UBND tỉnh Gia Lai ông Phạm Thế Dũng có những vi phạm, khuyết điểm nghiêm trọng, để lại nhiều hậu quả khó khắc phục, gây dư luận xấu trong cán bộ, đảng viên và nhân dân, làm giảm sút uy tin tổ chức đảng và cá nhân.
Cụ thể: khuyết điểm trong việc chuyển đổi 50.000ha rừng nghèo sang trồng cao su; giao đất, cho thuê đất không tổ chức đấu giá đất cho một số doanh nghiệp; quản lý đầu tư xây dựng một số dự án sử dụng nguồn ngân sách; cấp phép khai thác tài nguyên khoáng sản; việc mở và gia hạn hoạt động các cửa khẩu phụ, lối mở biên giới, cấp phép cho các doanh nghiệp nhập khẩu gỗ từ Campuchia về Việt Nam.
Từ những sai phạm trên, Ủy ban Kiểm tra Trung ương đã quyết định thi hành kỷ luật cảnh cáo đối với ông Phạm Thế Dũng.