Lũ trên các sông đầu nguồn ở Nghệ An, sông Ngàn Sâu và sông La (Hà Tĩnh) lên nhanh. Sông Hiếu tại Quỳ Châu đã đạt đỉnh ở mức 78.31 lúc 9h00 ngày 14/9, khiến 41 nhà dân phải di dời khẩn cấp. Tại Nghệ An đã có 4 người chết và mất tích (huyện Quế Phong 2 người, huyện Quỳ Châu 1 người, Nghi Lộc 1 người).