Mục tiêu chương trình nhằm đổi mới chính sách, tăng cường năng lực quản lý, phát triển hệ thống giáo dục trung học có chất lượng, nâng cao chất lượng đào tạo nguồn nhân lực.
Sau 5 năm triển khai trên 63 tỉnh, thành, theo kiểm định ban đầu của chương trình, dựa trên tiêu chuẩn mới được Bộ GD&ĐT ban hành có 89,8% trường THCS và 81,3% trường THPT hoàn thành đánh giá, kiểm định.